煙氣脫硫主要是脫出煙氣中的二氧化硫，礦石和燃料中的硫在燃燒的過程中與氧反應，主要產物是二氧化硫與三氧化硫，但是三氧化硫的濃度相對較低，一般占二氧化硫生成量的10%以下。由于高溫時三氧化硫的熱力學穩定性高以及低溫時二氧化硫的轉率極低，所以煙氣脫硫的問題主要是脫除二氧化硫而不是三氧化硫。